Cypher III+ is de gouden standaard op het gebied van besturingssystemen voor elektrische motorfietsen. Het stuurt op slimme wijze de vele componenten aan die de Zero DSR als een raket voortstuwen. De Zero DSR is volledig aanpasbaar en kan met nieuwe Cypher-functies worden uitgebreid via de NextGen-app, zodat je de motorfiets perfect aan jouw voorkeuren kunt aanpassen. Daarnaast is de DSR de enige motorfiets met de revolutionaire eigenschap dat de dealer hem van een A2-machine naar een A-machine kan upgraden zodra je meer ervaring hebt opgedaan. Deze upgrade is geheel aan Cypher te danken en alleen beschikbaar als je zelf aan alle lokale vereisten voor het A-rijbewijs voldoet.

Met behulp van Zero's intuïtieve NextGen-app en de dashboardinterface zijn de prestaties van de Zero DSR aan te passen door middel van een scala aan rijmodi. De voorgeprogrammeerde modi Rain, Eco, Standard, Sport en Canyon en een bijna oneindige hoeveelheid aanpassingen zorgen ervoor dat de DSR elke weg de baas is, hoe zwaar de condities ook zijn. Dankzij de Bosch Offroad MSC kunnen deze aanpassingen worden opgeslagen voor later gebruik, zowel voor op de weg als offroad.